此后吴三桂作为将领帮助清军消灭了李自成的大顺政权，清顺治十四年受平西大将军，会同清军进攻南明云贵地区。

十六年，清廷命他镇守云南，康熙元年吴三桂杀南明永历帝于昆明，被晋封为平西亲王并兼辖贵州省与镇守福建的靖南王耿精忠，镇守广东的平南王尚可喜相呼应成为拥兵自重的三藩。

清廷于康熙十二年下令撤藩，吴三桂闻讯后叛清，自称总统天下水陆大元帅，兴明讨虏大将军，发布檄文，挥军入湖南史称“三藩之乱”。

桂、川、云，贵，闽、粤诸省响应，战乱波及赣，陕，甘等省。康熙十七年，吴三桂称帝，国号周，又叫吴周，改元昭武。同年八月吴三桂病死，其孙吴世璠继位退据云南。

二十年昆明被围，吴世璠自杀，余众出降。明末清初着名诗人吴伟业为陈圆圆写的《圆圆曲》中有一句诗:“恸哭六军俱缟素，冲冠一怒为红颜。”将吴三桂背叛明朝投降清朝的原因归咎于吴三桂对陈圆圆无限宠爱。

这首诗一出来陈圆圆似乎永远也逃脱不掉红颜祸水的骂名了，其实，吴三桂作为一个面临国家兴亡时刻有很多算计的军阀他绝对不会因为陈圆圆被李自成的部将李宗敏掳走就投降满清。

就当时的情况来看吴三桂投降清朝是他反复权衡之后必然作出的选择。

吴三桂是典型的政治投机者，与当时明朝政治环境有关，加上崇祯皇帝朱由检生性多疑，是由信王身份继承兄长朱由校皇位的，根本没有学习过储君该有的东西，完全是赶鸭子上架，因事发突然而继位。

说道千古罪人难道只是某一个人吗？宋明两朝名面上是赵构，秦桧，吴三桂实则是士大夫阶层，宋朝自程朱理学出现汉人再无血性，宋，明两朝亡国之前皆有一个共同点:在中期程朱理学大行其道，残害妇女，女子缠足，三寸金莲，士大夫们对外软弱对内残忍，通过对妇女的各种迫害，什么贞洁牌坊，三寸金莲等方式来显示他们那点可怜的尊严，还美其名曰:孔子曰，孟子曰，哪道是孔子，孟子让他们迫害妇女的吗？”

光幕中文洛阳展示了三寸金莲，那令人作呕的画面让古人们差点没晕了，秦皇汉武，唐宗宋祖等之前的王朝帝王也是被恶心到了，自然也是怒了。

春秋\/战国时期的孔子，孟子也同样被气晕了，算是明白后世为什么要批判孔孟之道，为什么没有人再学儒家文化了，原因是篡改了儒家思想，还打上孔孟的旗号欺骗世人。