步科内容是军事课的重点，主要开设有战术、地形、工程、交通、兵器、辎重六大教程。教学内容比士兵阶段明显增加，野外演习拉练增加了次数，学员轮流当班长，图上作业，实兵指挥，操作各种武器，工程作业等十八般武艺，样样都得学，要求样样要掌握要领。
战术课程主要是学苏联红军、德军的战术原则，讲授的主要内容是苏联红军的经验。
朱德有时会给全校学员讲军事课，他的军事经验和造诣深如渊海，各种战例随手拈来，让学员们听得如痴如醉。文强等其他教官，用的案例，多是东征北伐时期的。中队长级教官，主要是在操场上指导学员的动作要领和班排战术。
外国的战例和经验，吴焜如听天书，他和许多低文化的学员，连德、俄这些国家在那里都不知道，总觉得枯燥无味，听不懂，学不进，导致军事素质提高慢。朱校长察觉外军经验用处不大，马上逐步减少，增加了中国近代战役案例。
吴焜在地形学的收获最大。川军作战，不喜欢挖工事，可长期生活在山区，每个军官对地形的利用，各有心得。课程要求每个学员，都要学会亲自测绘一张五万分之一的军事地形图，独立测绘，等高线要一一标示清楚。吴焜识图很快，要拿笔划图就可怜了。
可好在跟随的是中国顶尖级的军事“超级大师”，在朱德着手教育下、在冉秘书捉耳恶补下，在与李德彬“热烈讨论”下，吴学员终于“单独”完成了测绘课程，惊险过关。
兵器课的内容最为丰富和有趣。校方要求：学员要把步兵部队拥有的武器，包括步枪、手、轻、重机枪、迫击炮、步兵炮的机械性能和射击操作技术要领都熟练掌握，这是吴焜最感兴趣的学习内容，在新兵营他就基本掌握了，这次更加规范。
交通课程要求学员掌握如何组织运输。一辆车坐多少人？每车之间的间隔应该是多少？不同的天气、地形条件下，一天的运输距离多长最为合适等等。对交通工具的性能也要求有一定的了解。
许多学员未见过汽车，要求换成马车计算，卢振纲教育长不同意。一大队长文强苦思冥想，想到了电影。他跑到二马路电影院联系，选了一部有汽车行驶、坦克攻击画面的电影，放映时暂停在那里，讲结构、讲原理、讲功能、讲弱点要害，学员通过直观画面，效果良好。文大队长也因此受到朱校长的表扬。
工程课程要求学员掌握筑城、挖战壕、散兵坑、交通壕、城墙爆破等技术。以及如何修掩体，挖单兵坑，建机枪位，如何隐蔽，位置选择、射界判断，安全间隔。川军由于战斗环境的差异，多是小规模战斗，运动中的战斗，极少使用掩体和工事。军官和士兵不善于建造，有坑趴坑，无坑爬坡，能减少伤亡，保命就行。通过学习，了解到机枪在地形凸出部构筑工事的意义，是视界最大化，射界最大化，覆盖面广，学会了机枪阵地旁边要用土石堆高，留出凹型的垛口，做隐蔽，融入周围的环境。备用工事，交通壕沟，撤出壕沟，这些都是闻所未闻的。有些曾经参加过多次战斗的川军军官学员，学习后都有恍然大悟的感觉，更有当时未学，不然某位战友怎会……扼腕长叹……
此外，每个学员还要学会骑马，如何在马上射击、刺杀等技术。从各师团调来了十多匹战马，供普通班学员学习。人多马少，学员仅仅是掌握个要领，骑上能走就行。如瘦长子金冶平，在马上抖抖颤颤，坐稳就不容易，何谈射击刺杀？
由于自觉严格的训练，吴焜和徐允士、蔡奎、胡洪疆不仅增强了体能，掌握了一名军官应该具备的各项技能，还养成了军官应有的生活习惯，能够严格要求自己，服从命令，听从指挥，遵守军队的一切规章制度，包括内务制度、卫生制度和军容军纪。犹其是徐、胡二人，多次受到熊荫寰大队长的表扬，朱校长和卢振纲教育长也在校会上多次表扬。
训练也保留了一些老战斗技能，如耍大刀，练矛枪。
朱德军官学校教学的一大特点，就是非常重视课本知识与野战实践相结合。除了课堂讲解，每周两次拉练演习，雷打不动。没有实战经验的普通班学员，野外实弹演练更多。
野战演练时，要求学员掌握如何利用地形、地物行进射击，以及在敌人炮火下如何跃进和构筑工事等技术，最重要的是掌握对班、排、连分队战斗攻防的指挥，每个学员都要轮流当指挥员，锻炼指挥能力。这是考评一个学员是否符合一名初级指挥员的主要标准。
军校正式开学后，政治课内容也丰富和规范起来。
朱德还重点讲了万县“九、五”惨案时，万县军队，敢于向英舰开炮的伟大意义。
有一次演讲会上，朱德还讲了什么是社会主义，如何实现社会主义。
吴焜最爱听朱德讲话，他不仅穿着朴素，而且讲话风趣，声音洪亮，内容也与众不同，很有特色。他演讲的内容都是和工农兵生活紧密联系的事，总是强调中国的农民如何贫困、工人如何艰苦，鼓励学员，当兵，就是要打倒压迫在农工身上的帝国主义列强和军阀，要求学员要爱国家、爱百姓。他还常讲一些普通士兵的故事，痛斥部队官长克扣军饷的恶习。
所有学员对他都非常尊重、钦佩和爱戴，以能参加军校为荣。
每星期一总理纪念周的早晨，全校分驻两地的八百学员都要准时在大操场集中。
只要朱德在万县，他一定会参加并讲话，偶尔，杨森也会到军校露个脸。
政治讨论，是军校永远吃不完的一道大菜。受到校方的提倡鼓励，有时学员也会出讨论题，供大家讨论。
徐允士、胡洪疆、李德彬、蔡奎、金冶平等诸多活跃的学员与教官们，时常在一起议论时局，尤其对北伐谈得最多。许多教官在从军前，同样是教员、学生，像谌杰，还是上海的大学生，读过不少进步书籍，对国家形势有自己独到的看法。
通过系统的军事训练，徐允士、李德彬、胡洪疆、金冶平、蔡奎、吴焜等人发生了蜕变，从一名普通的低阶军官，逐步锻炼成具有当代军事素养和革命觉悟的军事指挥员。
更重要的是在这里，他们初步萌发了革命思想，受到了马列主义启蒙教育，初步接受了马克思主义。为他们今后冲开军阀的藩篱，走上了革命的道路，打下了思想基础。
对吴焜耳濡目染影响最大的是朱德！朱德为人正直、诚实，能吃苦，有毅力的品性，对人热情，与人为善的处世作风，丰富的阅历，影响着吴焜。朱德对吴焜像亲儿子一样关心爱护，不厌其烦的对他耳提面命的教育。在涉及国家前途命运的问题上，培养了吴焜独立的思考和见解，为他最终走上革命道路，奠定了思想基础。
正如莫湘在新中国成立后，回忆朱德在万县时“从未见他冒过火，发过脾气，一直是和蔼可亲地与人交谈，发觉到人的思想有问题时，总是旁敲侧击，循循诱导；见人行动上有错误的，总是明白指出，以理诲人”。
军校学员的成分和思想状况比较复杂，教官们有时很生气，朱德总是耐心地给教官们劝导：“这些人的思想是应改造，但也是可以改造的。我们有信心把他们改造成为革命的可靠力量，否则，怎能谈得上改造社会、改造人类、改造世界呢?改造人不是个个都一样，而是要了解不同的思想情况，做不同的工作。主要是：主动地接近他们而耐心细致地以理说服。我看是能够争取他们走革命这条光明大道的。”