伍守阳把曹还阳收留在家里，开始只是教一些烧炼外丹的技术活，伍守阳有点不愿意学，说这东西又不能成仙，换换吧。曹师傅便端起架子来训斥他：“你这泼猴，不对，抢了菩提的台词了，你这劣徒，为师传你外丹之法是看中了你的德才，你以为这是谁都有资格学的啊？还没学走就想学跑，想学成仙的内丹秘法，不学外丹哪行？好好学习，外丹学好了会传你内丹的。”

穷文富武，学修仙比学武更烧钱，自从开始学外丹，伍守阳家里更干净了，没办法，只能变卖那点田产。由于房子和地都没了，自然也就没有地方住了，于是师徒二人就四处溜达，饥一顿饱一顿，好的时候有间放烧柴的棚子睡一宿，多数时候直接天当被地当床，偶尔早上一睁眼还能看见只大老虎什么的在边上伸懒腰。祸不单行，伍守阳又生了好多毒疮，这样也没有打消他的向道之志。

满一年时，曹师傅对他说：“徒弟啊，经过一年的考验，你的向道之心已经达标了，这一点为师相当满意，所以我决定请示天庭批准后就传授你仙法。”

结果当然是没问题了，于是曹师傅开始正式传授修炼秘诀，伍守阳也正式成为龙门派第八代弟子。

正式加入大组织以后，生活并没有什么改变，师徒二人一直隐居在辟邪里，两家相距不到三公里，伍守阳每天吃两口早饭就跑到师傅家学习，直到晚上才回家。这二位是怎么又有了房子的不太清楚，道友们就不要纠结这个问题了。

每逢初一十五，二人还要举行一次表奏上天的仪式，希望哪天老天高兴了赏下一门无上仙法。由于还是穷，基本上是吃一顿饿三顿，时间一久肠道就受不了，最后终于犯了病。

就算是病得很重，伍守阳也没有想过去看看医生，为什么呢？师傅说过，修道以后可以把肉身炼成至宝，无论以前生过什么病，到时候全都会好了。果然，随着修为加深，从小就落下的病根，新得的肠胃病、老风湿之类的很快就好了。体会了仙道的好处后，伍守阳更加坚定地修行，对师傅的照顾也更加周到，想尽办法保证师傅家有吃有穿，自己忍饥受饿、倾家荡产也乐在其中，在乡人看来这人纯粹就是个傻子。

就这样，伍守阳坚持了十五年，十五年如一日的修炼，十五年如一日的侍奉师傅。曹还阳看到了伍守阳对仙道的矢志不渝，再加上最近十年间天仙曾三次下凡嘱咐他早点传授内丹功法，于是伍守阳终于学到了内丹法诀。据伍守阳回忆说，他在万历壬寅年（1602年）春天开始尝试突破百日筑基，终于功成，炼得大药。从此，伍守阳对内丹修炼，对王重阳的书更加深信不疑。

万历壬子年（1612年），曹还阳给伍守阳讲了仙佛合宗的秘诀，并且师徒二人第一次开始了外丹的炼制。从1593年学习外丹，到1612年第一次试验，二十年了，想想应该还是没钱的原因，连吃饭看病的钱都没有，哪有钱去买设备买材料啊。不过这次外丹炼制非常成功，把以前只能纸上谈兵的理论一一印证了一番，二十年的苦学、二十年贫穷的磨炼终究没有白费。

崇祯十二年（1639年），伍守阳从金陵回到南昌，和族弟伍守虚一起注解《天仙正理直论》。

崇祯十三年九十多岁的母亲无疾而终，伍守阳感觉尘缘尽断，再加上也没有新作现世，所以有人说他“隐迹仙去”了，也有人说他避乱进山清修了，还有人说他开始云游收徒传道，收过姚耕烟、谢凝素等弟子，公布内丹修炼的“天机”，但多是一些传说。

传说崇祯十七年正月初，伍守阳在武陵羽化。

总体来说，各种文献中关于伍守阳的记载存在很多相互矛盾的地方，至今还没有一个比较准确、详细的生平脉络，以至于各种传说虽然很多，也很精彩，但可参考的却有限。

伍守阳留下的丹经不少，第一部着作是《天仙正理直论》，是1615年传授弟子朱太和内丹功法时，朱太和记载下来的。初次成书于天启二年（1622年），1639年伍守阳又拿出来进行了二次整理最终定稿。

内容从朱太和问“火候”开始，有问有答，主要内容有先后二天论、药物论、鼎器论、火候论、炼己论、筑基论、炼药论、伏气论、胎息论，虽仅有九章，但“道明无极”，“完全画出一个天仙样子”，全面记载了伍守阳的内丹功法。

第二部着作是《道原浅说篇》，这是伍守阳内丹理论的总纲，主要包括顺为人逆为仙的理论、修炼三关和财侣法地等内容。

第三部着作是《仙佛合宗语录》，同样是朱太和完成的，从1632年开始整理了八年，共九章：最初还虚、真意、水源清浊真丹幻丹、火足候止火景采大药、七日采大药天机、大药过关服食天机、守中、出神景出神收神法、末后还虚。内容是师徒二人的论道过程中讨论的很多具体的功夫，可以说是对《天机正理直论》的补充，正如伍守阳自己说的，这部着作“备龙门秘法天机”。

还有一部《天仙论语》，大约是在1639年开始，耗时两年整理成集，是伍守阳和朱太和等弟子间的一些关于清修丹法和外丹的一些问答。

此外，还有《丹道九篇》《金丹要诀》等，多数都是通过伍守阳与门人或其他道友问答的形式讲修炼的经验。