学习性命双修的大道以后，刘一明便一边在西北行医游历，一边修炼金丹，45岁那年他来到了栖云山。栖云山现在是四家级4A景区兴隆山内的一座山峰，离兰州市区不远，有些资料上说刘一明在栖云山传道，有的文献上则说是在兴隆山，道友们清楚二者的关系就好了。栖云山的自然生态环境自然是极佳的，原来也是修道的洞天福地，可惜当时宫观建筑破败得太过厉害，满眼一片残砖断瓦，哪还有一点修行圣地的样子。于是，刘一明下决心要重修兴隆山，恢复当年的盛况。
这么大的工程显然不是他一个人能完成的，不过这都不是事儿，这么多年在西北游历，一手医术活人无数，高官、土豪谁不想和他套套近乎？于是，刘一明站在山头上振臂一呼，四方响应，有钱的出钱，没钱的出人，仅用了两年的时间，上山的石阶修补好了，倾颓的建筑也立起来了，久违的晨钟暮鼓和袅袅香烟也重现了，初显了名山圣境的样子。
当然了，那时候的盖房子的水平还远远没有达到如今基建狂魔的万一，虽然有大量信众的支持，前也后花了14年，才最终完成了整体工程。此时，刘一明倒背双手，在山脚下抬头仰望，只见青石台阶蜿蜒山间，串起62座庄严肃穆的主体建筑，错落山间的还有二十处雅致景观，最重要的是十几年来有大量的弟子门人成长起来了，这才有八方香客信徒络绎不绝，慕名而来的同道高人也越来越多，兴隆山真正成为了西北的道教圣地，嗯，是时候闭关写点文章了。
修了这么多宫观，刘一明并没有给自己安排个别墅住，甚至连一间小房间都没有，而是一直在山上的一个小石洞中修炼，还自娱自乐给它起了个名字——自在窝。
刘一明在西北有很多传说，关于这个自在窝也有一个小故事。
传说吕洞宾曾经三次来点化刘一明，但都被他不识真仙错过了，反而他的一个每天赶着骡子从山下运水的弟子得了仙缘。刘一明事后自然非常懊悔，于是就搬到了弟子住的地方，每天静修悟道，这就是自在窝。有道友问了，他搬到自在窝住了，弟子住哪啊？弟子已经先于他修成正果，成仙了。
另外，这头运水的骡子也有故事，是他的一个弟子为了还债转世的，被刘一明领回山上来的。从这些故事可以看出，刘一明在民间，当然主要是在西北还是有相当的影响力的，除了他的医术高超以外，主要还是因为他的道法高深，在老百姓的眼中，他就是个神仙人物。
当年刘一明住的自在窝1991年被重装修过，条件比当年好了很多，不但分了上中下三层的跃层结构，而且在外面还安了一个大门。
就这样，刘一明一边在兴隆山着书立说，一边传道授业。在他82岁的时候，该写的心得笔记也都写完刻印了，感觉一身轻松，随手写了一首《绝言歌》抒怀。这首诗被后人附在了《通关文》的后面，能看得出来，刘一明当时有一种心愿尽了，封笔江湖的意境在里面。
就这样又在山中安心过了几年清静日子，道光元年（1821年）正月初八立春亥时，刘一明自己走进了早就修好的墓里面，顺便把一众弟子叫了过来，看大家排队立正后，还真有向遗体告别的仪式感，于是留下一句“性命为重，功行为先”后便羽化了。
与他同时代的，远在南方的，也是龙门派第十一代弟子的闵一得得知刘一明羽化后，感慨颇多，在他看来，刘一明绝对称得上是全真龙门派的一代宗师，水平比自己高太多了，用他的话说自己和他比，就是小巫见大巫，这当然是人家自谦的话，也是对死者的尊重。
南怀瑾对刘一明也非常认可，在讲座时曾多次说过：“清代学者颇多，而以乾嘉道学着者刘悟元、朱云阳二人为其翘楚，尤以刘悟元之说理修炼，纯主清净，力排方士诸说，参合佛理要旨，于丹道法中，又别创一格。”朱云阳又叫朱元育，在前面提到过的，南怀瑾认为他所注的《参同契》是最好的，个人感觉也确实如此，另外他注的《悟真篇》也值得一看。
简单讲完刘一明的生平，下面先讲一讲他的传承问题。
学术界比较统一地认为刘一明是龙门派的第十一代传人，有些人说是第十一代宗师，总之他是全真龙门派的。上面也讲过，刘一明有两位重要的传道者，一个是龛谷老人，一个是仙留丈人，这两位的资料又不多，也没有明确的记载他们是龙门派的弟子。除了他们二位以外，无论是刘一明自己写的东西里面还是其他文献里面，至今还没有发现有关他的师承以及什么时候、在哪里皈依的记载，要知道龙门派是有传戒的，特别是从王常月以后，入门是很讲究仪式感的。有道友可能会说，龛谷老人传了他丹理，仙留丈人传了他丹法，这二位的法脉传承虽然还没有查到，但是看丹法内容应该是龙门派的吧。当然，通过刘一明在西北的活动，留下的着作等可以推测他是龙门派的传人，但是目前只能说是推测。
挺有意思的是，闵一得有很多和他相似的地方，比如也是因为体弱多病才与道结缘，二人一南一北，同样是继王常月以后重振龙门法脉的，不过闵一得是有明确的师承——龙门第十代传人高东篱。
刘一明的主要作品有《易理阐微》《孔易阐真》等，嘉庆二十四年（1819年），他的着作及注疏被汇集刻印成册，名称为《道书十二种》。从刘一明的着作中可以看得出来，诸如《参同契》《悟真篇》《西游记》《周易》等是他极为看重的。
《修真辨难》是他的第一本着作，是在内丹理论体系完善以后开始写的，讲了他对丹道的理解，比如宇宙观、生命观以及修炼方面的一些东西。