在与小春和琉琪亚告别之后，小智与小遥和小刚两人汇合，然后就乘坐联络船，前往绿岭市了。</P>

途中，小智一行人路过了一众小岛。</P>

在邦巴岛上，小智一行人遇见了一个来这里的宝可梦裁判学校学习的男生，叫做吉米，</P>

这个吉米运气好到让人嫉妒，运气好到几乎是躺着都能挣到钱的水平。</P>

他以前是一名宝可梦训练家，他的初始宝可梦是杰尼龟，后来进化成了卡咪龟，一次他们的食物丢了，被一只野生的妙蛙草吃了，而这只妙蛙草居然愿意主动被他收服。</P>

还有，有一次他不小心摔进了河里，被卡咪龟和妙蛙草救起来之后，发现他的衣服里居然夹了一只闪光的黄金鲤鱼王！</P>

然后，一位非常喜欢鲤鱼王的大叔经过，用一只火恐龙换走了这只黄金鲤鱼王。</P>

之后，他路过关都地区的时候，因为道馆训练家小霞不在，而他又帮助华蓝道馆的樱花小姐清洗了道馆里的水池，就从樱花那里获赠了一枚蓝色徽章。</P>

不过他的悲催就是，宝可梦对战从来都没有赢过，所以他现在才想来当宝可梦对战的裁判。</P>

但是他现在才刚刚开始训练，水平很低，经常对宝可梦有没有失去战斗能力判断错误。</P>

另外，这个宝可梦裁判学校里的女老师，竟然也叫莎莉娜，跟小智的正宫莎莉娜同名。</P>

莎莉娜能够一针见血地指出她的学生问题，但也可以发现学生身上的闪光点，她会在必要的时候鼓励她的学生，她同样不愿意限制自己学生的未来。</P>

在看到吉米的潜力之后，她强制要求吉米从宝可梦裁判学校退学，因为她认为吉米还有更多的可能性，可以将宝可梦的能力进一步开发出来。</P>

吉米也决定听从莎莉娜老师的意见，前往水静市，展开他的训练家之旅。</P>

之后，在瑞弗勒岛上，小智一行人再次遇见了之前见过的那只野生的跳跳猪，它头上的真珠又不见了，而且还是掉进了海里，这该从何去寻。</P>

不过，这座岛上最常见的宝可梦就是珍珠贝，在这座岛上的珍珠贝研究所里，一名研究员告诉他们说，可以用珍珠贝的珍珠来代替。</P>

于是小智一行人便找了一只野生的珍珠贝，取走了它的珍珠，给了这只跳跳猪。</P>

接着，在瓦滋瓦岛上，小智一行人跟着一个名叫草也的纪念品店老板一起乘坐潜水艇下水寻宝，老板娘莉桃负责在海面的船上接应。</P>

草也知晓一个古空棘鱼与沉船的宝藏的传说，但是最后费了一大番功夫，只打捞上来一箱子绿色碎片。</P>

这就是一种普通得不能再普通的道具，100块钱一个，价格跟一个精灵球一样，根本就提不起小智的兴趣。</P>

紧接着，在伊吕波三岛（伊岛，吕岛，波岛三个岛的合称）这里，小智一行人在伊岛上遇见了小田卷博士，他是来这里调查，为何珍珠贝在吕岛上只会进化成樱花鱼，而在波岛上却只会进化成猎斑鱼。</P>

对此，吕岛和波岛的人们也彼此争论不休，内容是喇叭芽和樱花鱼哪个比较厉害。</P>

经过调查，众人发现，在吕岛的水里含有深海之鳞的成分，而在波岛的水里，则含有深海之牙的成分，并且也在吕岛的水泉里找到了深海之鳞，在波岛的水泉里找到了深海之牙。